Efficiente protocollo di purificazione del DNA per il rilevamento delle impronte digitali di canna da zucchero

La canna da zucchero (Saccharum officinarum L.) è una delle colture leader nel mondo. La caratterizzazione molecolare e la selezione assistita da marcatori molecolari nell'allevamento della canna da zucchero potrebbe essere uno strumento per il miglioramento di questa coltura in grado di aiutare ad aumentare la produzione di zucchero. Come molte altre specie vegetali, i tessuti della canna da zucchero contengono alti livelli di polisaccaridi e composti polifenolici, che presentano un grave problema di contaminazione durante la purificazione del DNA. Alte concentrazioni di polisaccaridi, che co-purificano con il DNA nelle normali estrazioni di fenolo-cloroformio e i polifenoli si legano covalentemente al DNA rendendolo inutile per la maggior parte delle applicazioni di ricerca. Una procedura di purificazione del DNA rapida, efficiente e facile per la canna da zucchero è una necessità urgente nei programmi di mappatura del genoma e di selezione assistita da marcatori (MAS). Nella presente indagine è stato sviluppato un metodo efficiente e facile per l'isolamento del DNA di alta qualità dal cilindro meristematico della canna da zucchero. Con il metodo sviluppato è stato possibile l'isolamento del DNA di alta qualità senza l'uso di azoto liquido, omogeneizzatore di tessuti e utilizzando una semplice microcentrifuga. Il DNA isolato è stato ben eseguito per l'amplificazione PCR e l'analisi delle impronte digitali del DNA con l'uso di marcatori RAPD.